以借牌方式進入FBA倉
臺灣業者透過跨境電商平台(如Amazon)銷售和一般傳統貿易不同之處在於Amazon僅提供一個銷售的平台，並沒有向臺灣賣家買斷商品，所以Amazon並不是臺灣賣家的進口商。因此，當臺灣賣家的貨要進口運到Amazon的FBA倉時，必須找一個當地的法人來當進口人，才能處理進口程序。以日本市場為例，由於大多數臺灣賣家沒有在日本設子公司或分公司，所以就找其他日本貿易公司協助，以該貿易公司的名義做為進口人。該貿易公司並沒有買斷臺灣賣家的商品，且商品在通過日本海關後，就直接進入FBA倉，不會進到該貿易公司的倉庫。這種做法也是實務上俗稱的借牌方式。也有些賣家在初期小量試單的時候採用快遞方式直接將貨品寄到FBA倉，但要大量出貨還是以借牌方式為主流。
日本海關針對進到FBA倉的貨物採逆算法計算關稅和消費稅
原本透過借牌方式進入日本，在清關時日本海關是依據該商品申報的HS CODE課以關稅和消費稅，而完稅價格的計算基礎是依業者申報的invoice價格(通常是採購成本或售價的30%)。就如同一般傳統貿易的做法。但是在海關依invoice金額課完關稅及消費稅後，理論上賣家透過Amazon平台以最終售價售出商品後，還要把跟消費者收到的消費稅(依最終售價計算)扣抵清關時繳納的消費稅後將差額繳給日本政府。
但海外賣家在Amazon上以境外公司名義開的發票，對日本政府而言是課不到稅的，所以前述的差額也連同貨款以第三方金流方式流出日本。這就造成了一個稅務上的漏洞。再加上許多海外賣家在借牌進口時，將invoice的價格低報非常多，更惡化了這個問題。
所以，自2020年4月起，日本海關開始針對進到Amazon FBA倉的貨物採用逆算法計算關稅和消費稅。也就是針對上述以借牌方式直接進到FBA的海外賣家採取較嚴格的標準。逆算法是指由貨物在Amazon上的售價扣除通關費用、平台手續費、及日本境內物流費後為申報價格。逆算後的申報價格可能是售價的50%-80%，較原來invoice價格(售價的30%)高很多，使得關稅和消費稅的計算基礎大幅增加，也增加了業者的成本。
採用海外倉做為中轉
為了避開日本海關對於送到FBA倉商品的查核，各地的物流業者和業者們也想出了許多因應方式。當中相對合法的方式是採用海外倉做為中轉。雖然還是借牌，但貨物的收貨地址非FBA倉，所以海關沒有發現這是要在Amazon上銷售的商品，就會視同一般正貿的商品依invoice價格計算關稅和消費稅。
若要以海外倉中轉，賣家要注意外箱不要貼有FBA的標籤，但內箱還是要貼產品標籤，待進到海外倉後加貼FBA標籤才轉送FBA倉。此外，提供給海關的Invoice價格也不可低報，因為會提高被查驗的風險。
上述情況是屬於走貿易清關的貨物，且只針對進到FBA倉的商品，其他平台的商品或快遞清關不在此列。目前日本海關還沒有管到以快遞方式寄送到FBA倉的貨品。所以快遞商品仍以自主申報的價值課稅。但未來很難說是否會管到快遞貨物。若日本海關發現快遞變成一大漏洞時也可能會加以管制。
其實日本海關對於跨境電商商品的查核標準或方式一直變動，究其原因，就是來自於跨境電商業者在日本境內沒有法人，無法課稅，造成對在日本設立法人的貿易商或本土業者不公平的情況。長期而言，日本政府應該會針對跨境電商的業者設立一套標準，例如美國的做法是要求電商平台上的海外賣家申請稅號才能做為進口人。在那之前，可以想見產業界還是會有許多和日本海關鬥智鬥法的過程，不過要長期在日本經營品牌的業者，還是建議採取合法方式進口。
